Prince of Persia: Dwa Trony to przygodowa gra platformowa XNUMXD z ogromną ilością zagadek i przeciwników, będąca kontynuacją dwóch poprzednich części. Książę Persji, po zabiciu strażnika Czasu Dahakusa, wraca do Babilonu z cesarzową Kaileeną, ale ich statek zostaje zaatakowany w drodze do domu. Kaileena zostaje schwytana, gdzie zostaje zabita. Piaski Czasu, które opuściły ciało dziewczyny, spadają na rany księcia otrzymane w walce i tworzą jego mrocznego sobowtóra. Teraz zadaniem księcia jest pokonanie własnego mrocznego „ja” i wyzwolenie królestwa.